膜荚与蒙古黄芪植物学特征基本相似，营养器官的解剖结构也基本相同，但在种子和幼苗形态、花粉形态及染色体核型等方面存在明显差异。
(1)植物形态差异。膜荚黄芪的幼苗较蒙古黄芪高大、粗壮，表面密被长柔毛，在电子显微镜下看表皮毛表面密被乳头状突起；第1至第4片真叶为三出羽状复叶，第5真叶开始出现具5小叶的羽状复叶并逐渐增多，成熟时小叶可达13～27枚；小叶较大，长7～30mm，宽3～l0mm；而蒙古黄芪疏被短柔毛，毛表面较光滑，第2真叶即为具5小叶的羽状复叶，成熟时小叶多达25～37枚，小叶长5～l0mm，宽3～5mm。
(2)荚果和种子差异。膜荚黄芪的荚果表面附生黑色短柔毛，种皮表面纹饰为复网状；蒙古黄芪的荚果无毛，种皮纹饰为皱折状。两种黄芪种子在肉眼和光学显微镜下观察，种子的形态差异不明显，但在电子显微镜下观察，两种黄芪种子的萌发孔形状、种脐和种皮的微观结构有明显差异；蒙古黄芪较膜荚黄芪种子硬实率高，萌发不整齐，萌发高峰滞后。
(3)花粉粒差异。膜荚黄芪的花粉粒近圆球形，萌发沟短而宽；蒙古黄芪的花粉粒长球形，萌发沟细。
(4)染色体差异。膜荚黄芪的染色体核型公式属于1B型，蒙古黄芪染色体核型公式属于1c型。
豫公