目前设施蔬菜大棚菜农仍未能很好的掌握辣椒病虫害的防控，基层农资商也未能熟练掌握辣椒病虫害的诊断与防治技术。只注重病害的防治，发现病虫害就想着喷药，而忽略了对病害的预防，尤其是不能及时通过调整栽培管理技术预防病害。同时使用01%-03%硫酸锌溶液或纽萃锌1500倍液进行喷雾增强抵抗能力，减少病毒病发生。若发病，在发病初期可使用病毒A500-750倍液、康润Ⅱ号1500倍、太抗300-500倍液喷雾，间隔7-10天用药1次。
辣椒喜欢温暖的气温，喜水和喜肥，但高温容易得病，水太多易秧苗，肥多易烧根， 所以在整个生长期不同的阶段要有不同的管理要求。第一，在品种选择上，选择抗病能力强的品种，从根本上减少病害的发生；第二，选择地势较高，排水良好的地块，加强田间管理，减少病害发生；霜霉病等二十多种，常见的虫害有烟青虫、烟青虫、蚜虫、斑潜蝇等十几种。可以说，辣椒病虫害无时不在，无处不有，每时每刻都要小心预防，稍有疏忽，就会遭到病虫害的无情袭击。
必须科学栽植，合理施肥。选用抗病毒的优良品种，播种时进行种子消毒；尽量做到不与茄果类蔬菜轮作和重荐种植。做好田间管理把有病害虫的辣椒、病叶及时摘除带出集中销毁或是深埋。有发现病植及时打药防治，防止病菌相互传染。细菌性斑点病 这种病害在辣椒整个生长期间很常见，病症为:叶片出现很多病斑、斑点，导致叶片枯黄、脱落，最终落果。这种情况一般是在长期高温、高湿度、空气不流通的环境下发生。辣椒种植时要控制好间距，以便通风透光，做好水分管理，防止田间水分过多，在秋冬季做好清园工作，清理残枝枯叶，集中烧毁，发病后适当喷洒粉锈宁、甲基托布津等药剂，出现虫害的话，要喷洒苦参碱、鱼藤酮、吡虫啉、苦参碱、印楝素，蚜虫可以使用黄板引诱。
辣椒种植中常见病害
1、花叶病：病株上部叶先现浓绿淡绿相间花叶，情况严重的话，叶子变黄，病株长势弱、节间短、开花畸形稀少。
2、病毒病：主要影响辣椒的叶子、果实的生长，病部不规则退绿，病果畸形，凹凸不平，易脱落。
3、青枯病：病株根系褐变后会腐烂，横切近地面病茎可出现褐变，还会分泌出乳白色菌液，后期病株迅速萎蔫、枯死，茎叶仍保持绿色。
4、软腐病：主要危害果实的生长，刚开始有水渍状暗绿斑，后面会褐变黄腐烂，遇外力易脱落，有伤口的话会流出溃液，不掉则挂干剩白皮。
栽培辣椒主要虫害
1、棉铃虫：棉铃虫是辣椒生长期间常见的害虫，不仅会影响辣椒的生长，同时也会影响到其他茄果类蔬菜，危害花蕾、花朵、果实的生长，花蕾变成黄绿色，之后自然脱落，啃食果实的蒂部，导致雨水或病菌进入到果实内部，果实掉落。
2、蚜虫：辣椒出现蚜虫危害的话，叶子畸形卷缩，整棵植株长势减弱、矮小，导致产量下降，蚜虫还会传播其他病毒，导致辣椒病害发生。
3、甜菜夜蛾：甜菜夜蛾主要危害叶片生长，叶子容易感染病害，还会影响叶片产生光合作用产物，从而影响辣椒果实的膨大。
4、烟青虫：烟青虫的幼虫啃食辣椒的花蕾、花朵和果实，被蚕食的花蕾、花朵和果实会腐烂脱落，大大降低了辣椒的产量，受到烟青虫危害严重的地块，损失率会高达30-80%之间。
辣椒病虫害防治
1、病害：辣椒种植时要控制好间距，以便通风透光，做好水分管理，防止田间水分过多，在秋冬季做好清园工作，清理残枝枯叶，集中烧毁，发病后适当喷洒粉锈宁、甲基托布津等药剂。
2、虫害：及时剪掉病虫枝叶，在虫害初发期可喷洒苦参碱、鱼藤酮、吡虫啉、噻虫嗪、噻虫胺，蚜虫可以使用黄板引诱，或用吡虫啉、溴氰虫酰胺等喷雾，烟青虫可用苦参碱、印楝素等喷雾。
辣椒疫病主要为害叶片、果实和茎，特别是茎基部最易发生。病菌以卵孢子在土壤中或病残体中越冬，借风、雨、灌水及其他农事活动传播。发病后可产生新的孢子囊，形成游动孢子进行再侵染。重茬、低洼地、排水不良，氮肥使用偏多、密度过大、植株衰弱均有利于该病的发生和蔓延。
防治方法：
（1）实行轮作、结合土壤深翻后喷洒新高脂膜800倍液，适量施用氮肥，改善土壤结构，提高保肥保水性能，促进根系发达，植株健壮。
（2）定植辣椒苗之前和定植当天，分别细致喷洒两次护树将军杀菌消毒，做到净苗入室，减少病害发生。
（3）结合根外追肥和防治其它病虫害，在辣椒的开花期、生长期、成熟期及时喷洒辣椒壮蒂灵，提高番茄植株自身的适应性和抗逆性，提高光合效率，促进植株健壮。调控好植株营养生长与生殖生长的关系，促进植株健壮长势，提高营养水平，增强抗病能力。
（4）全面覆盖地膜，加强通气，调节好温室的温度与空气相对湿度，使温度白天维持在25－30℃，夜晚维持在14－18℃，空气相对湿度控制在70%以下，以利于番茄正常的生长发育，不利于病害的侵染发展，达到防治病害之目的。
（5）在化学防治上，定植前要搞好土壤消毒，结合翻耕，喷洒新高脂膜800倍液杀灭土壤中残留病菌。定植后，适时喷洒护树将军1000倍液进行保护，防止发病。如果已经开始发病可选用以下药剂： 70%甲霜灵锰锌或70%乙磷铝锰锌500倍液，25%瑞毒霉600倍+85%乙磷铝500倍液，75%百菌清800倍液等。以上药液需交替使用，以便提高药效，增强植株的抗逆性能，提高防治效果。
豫公