把玉米秸秆焚烧用其实有些浪费，而且会造成空气污染。楼主所说的让等待变肥料的菌种，估计是华夏康源肥料发酵剂，可以将秸秆发酵处理成有机肥。发酵秸秆流程如下：
1、1～15吨秸秆物料（鲜料约25～35吨）加1公斤金宝贝肥料发酵助剂。由于发酵剂中的菌种是好氧菌，在物料混匀前最好将每公斤发酵剂加5~10公斤米糠（或麸皮，玉米粉）拌匀稀释后再均匀撒和物料堆，使用效果更加。物料混好后需要拌匀通气。
2、发酵物料的C/N比例保持在20~25，PH值调到6～8为好，水分控制在60~65%为佳，判断方法：手抓一把物料，见水不滴水，落地即散为宜。启动温度应在15度以上，发酵升温控制在70度以下。
3、正常情况下，一周之内即可发酵完成，后期物料堆温度不在变化，秸秆稻草等轻拉即断，发酵产物略带酒香或泥土味，表明发酵完成。
4、发酵好的秸秆有机肥，因为已经充分发酵腐熟，肥效温和持久，不存在烧根烧苗现象，必须做浅层施肥，避免深施。秸秆发酵成有机肥后，可施用于田中。促进土壤有机质及氮、磷、钾等含量的增加；提高土壤水分的保蓄能力；改善植株性状，提高作物产量；改善土壤性状，增加团粒结构等优点，并且增肥增产作用显著，一般可增产5%～10%。发酵秸秆还田技术，杜绝了秸秆焚烧所造成的大气污染，培肥了地力。
制作有机肥的方法：酵素菌堆肥、杂草发酵法、秸秆发酵法、高温发酵法、蔗渣发酵法。
1、酵素菌堆肥
将麸皮、钙镁磷肥、红糖、酵素菌混合均匀，然后加入鸡粪，依次撒施在水湿透的秸秆上，搅拌均匀后堆于池内，稍微的用重物压一下，然后每天观察堆肥的温度、湿度，最适宜堆肥发酵的温度为60～65℃、湿度为50%～60%，在堆肥变成黑褐色腐烂状态，无光泽，且无任何异味时，说明制作完成。
2、杂草发酵法
杂草的可以选择的很多，如玉米杆、稻草等等都是可以的，首先在地面铺上7-10cm厚的塘泥或细土，盖上一层杂草，然后泼上少量的人粪尿，接着覆盖7-10cm的细干土，依次堆积到15米高后用塘泥密封，经过一个月后翻堆一次，再密封。15～20天后可施用。
3、秸秆发酵法
用晒干的稻草、麦秸以及细干土、人畜粪按照6:3:1的比例进行沤制，在混合前的一天要用水将秸秆浇透，然后混合细干土、人畜粪堆积到15米高，顶部用塘泥密封。25～30天后翻堆1次，再密封。15～20天后可施用。
4、高温发酵法
猪、牛、羊等畜粪与草皮或鲜嫩杂草按2：1的比例加适量水拌匀后堆成堆，用塑料薄膜密封沤制。25～30天后可施用。
5、蔗渣发酵法
很多糖厂会产生大量的蔗渣、滤泥、废醪液、炉灰等，这些可以经过生物高温发酵，生产出优质的生物有机肥。首先将蔗渣和腐熟菌种按照50cm进行分层混发酵，期间不断的喷洒醪液以增加水分，等到水分干时，可以适量的加入滤泥和炉灰以增加养分，一般发酵15～30天后可施用。
秸秆发酵之后可以做成有机肥，还可以发酵做成饲料的。
（一）农盛乐发酵剂发酵秸秆做饲料的步骤：
1、原料准备。应先将秸秆按要求粉碎或切成小段或丝状，其中用于喂牛、马、骡的饲料原料应切碎成2－5厘米，喂羊、鹿应切碎成2厘米左右，喂猪、鸡、鸭、鹅、兔的秸秆或者藤蔓应粉碎。可以单独用秸秆发酵剂，也可将喂饲用的玉米粉掺入一同发酵，效果更好。
2、混合原料。调整湿度：将备好的秸秆物料加水搅拌均匀，含水量控制在60%左右，判断标准为：用手紧抓一把物料，指缝见水不滴水，松手即散为宜。秸秆与水比例大致为15：1左右。农盛乐秸秆发酵剂一包可配置10公斤发酵菌液，按照1公斤发酵菌液发酵秸秆400斤的比例，用新的喷壶（喷雾器）将发酵
剂均匀的喷洒在物料上，要一边喷洒一使之均匀。
3、密封发酵。将上述拌匀后的秸秆装填密封、量大用户可建造发酵池，批量处理，夏秋季节发酵时长为5-8天，冬季发酵时长需10-15天。
4、发酵控制。用于饲料发酵时为厌氧发酵，发酵过程要保证密封，以防变质，发酵装填时可踩实，赶出空隙中的氧气。
5、饲料取食。由外向里逐层取料，可延长饲料保存时间。发酵饲料可单独喂饲，也可掺入全价料中饲喂。第一次饲喂发酵饲料的畜禽，应先少量试喂，待适应后，可逐步增加喂饲量。
注意事项：
1、原料。不能使用霉烂变质或有毒性秸秆，否则可能抑制有益微生物繁殖，影响发酵；同时对喂饲的畜
禽造成不良影响。
2、密封。使用农盛乐秸秆发酵剂发酵饲料过程为厌氧发酵，应密封发酵；
3、避光。不要在阳光直射的地方发酵，以防紫外线杀灭功能微生物，影响发酵。
4、搭配。因各类秸秆营养成分和各种气味不同，发酵后的饲料味觉也有一定差异，合理搭配原料发酵效
果会更好,营养更全面。
（1）粗精搭配，如在秸秆中加入10-15%左右的玉米面一同发酵；
（2）品种搭配，多种作物秸秆混合发酵，如玉米秸与小麦秸混合等等，这样营养更全面，效果更好。
（3）饲喂搭配。发酵好的秸秆饲料，应按所需比例与全价饲料混合物拌匀一同饲喂，牛、羊、鸭、鹅和空怀母猪，可直接饲喂，猪、鸡应按比例混喂。
5、重量。每次发酵秸秆重量一般应不低于200公斤，量太少不利于升温，难以保证发酵质量。
农盛乐发酵剂功效作用：发酵过程中分泌与合成的大量活菌、蛋白质、氨基酸、各种生化酶、促生长因子等营养与激素类物质，能调整和提高动物机体各器官功能，提高饲料转化率，对动物产生免疫、营养、生长刺激等多种作用，达到防病治病、提高成活率、促进生长和繁殖、降低成本、消除粪尿臭味、净化环境、增产增收等效果。饲喂三天肉眼可见明显效果，表现为：
1、改善饲料适口性，提高采食量及速度；
2、显著增加饲料营养成份，能转化成动物所必需的多种营养全面的有效氨基酸成份；
3、提高饲料消化吸收利用率；
4、提高免疫力，预防并治疗肠道疾病，建立肠道微生态平衡，抑制有害病菌的繁殖，增加有益微生物繁殖；
5、除臭驱蝇，从而减少环境污染；
6、改善肉蛋奶品质，生产“绿色肉”、“农家蛋”、“无抗奶”，本品通过增强消化吸收功能，充分吸收利用饲料中营养成分及原料的天然色素，无需添加化学色素苏丹红、加丽素红造成对人体的有害物质及影响畜禽产品天然食用风味，可媲美家养畜禽肉。能天然增加动物产品着色度和食用风味，猪只皮肤红润，毛色发亮；肉鸡肉鸭颜色加深；改善蛋壳的质量和颜色，蛋清厚稠，蛋黄鲜红；水产动物颜色更加健康，无斑点。
（二）、农盛乐发酵剂发酵秸秆等做肥料的方法：
以发酵加工后的有机肥料为载体。加入益生菌加工而成的生物有机肥料，是指一种含有益于作物生长的发酵微生物的特定有机肥料，它既具有微生物肥料的功效，又具有有机肥料的作用。应用于农业生产中，具有显著的增产效果。这种肥料制作比较简便。如：利用发酵加工后的干基有机肥料1000公斤，加入5%的益生菌，经充分混合、翻倒、拌均，加工制成含菌量≥05亿/克的生物有机肥料。生物有机肥料，适用于各种土壤、各种农作物，具有相当显著的肥料效应。
生物有机肥料是一种完全的肥料，有机质含量十分丰富，不但富含氮、磷、钾等大量元素，还含钙、镁、硫、铁、锰、锌、铜、硼、钼、氯等中微量元素，生物有机肥料中的功能菌即能分解土壤中的矿物磷，又能分解土壤中的矿物钾，释放出磷、钾等多种营养成分，可持久的给农作物提供源源不断的养分。从多年的使用效果来看，生物有机肥的肥效，在各种作物上的验证取得了另人满意的效果。得到了广大农民的认同。随着我国有机农业的快速发展，生物有机肥料越来越展示出具大的市场前景。
制肥场地的选择：
制肥场地应选择地势平坦，靠近水源的背风向阳处，一年四季均可露天制作。
制肥材料的准备：（以1吨干秸秆为例）。
①作物秸秆1000公斤。
②饼粉20公斤。花生饼、豆饼、棉籽饼、菜籽饼等均可，无饼粉可用10公斤尿素代替。
③农盛乐发酵液3公斤。
制作方法：
① 把作物秸秆（如玉米秆）用粉碎机粉碎或用铡草机切断，一般长度以1-3厘米为宜（麦秸、稻草、树叶、杂草、花生秧、豆秸等可直接使用发酵，但粉碎后发酵效果更佳）。
②把粉碎或切断后的秸秆用水浇湿、渗透，秸秆含水量一般掌握在60%左右。
③用20公斤饼粉同3公斤发酵液拌匀，用手均匀地把拌有菌种的饼粉撒在用水浇过的秸秆表面。用铁锹等工具翻拌一遍，堆成宽2米、高15米、长度不限的长条，用草席等透气材料覆盖即可。肥料发酵为有氧发酵，不必完全密封。
秸秆腐化过程：
①升温阶段：从常温升到50℃，一般只需两天。
②高温阶段：从50-70℃一般只需三天。
③降温阶段：从高温度降到50℃以下，一般十天左右，此时秸秆制肥过程基本完成，肥料可直接施用。
秸秆肥腐熟标志：
⑴秸秆变成褐色或黑褐色，湿时用手握之柔软有弹性，干时很脆容易破碎。
⑵发酵充分或者反应剧烈的话，可闻到酸气。
秸秆肥的施用方法：
⑴ 秸秆肥一般用作基肥，可潮湿施用。做追肥应覆土。半腐熟的肥料施用于生长期较长的作物，腐熟度高的秸秆肥施用于生长期较短的瓜果蔬菜等作物，沙性地用半腐熟的肥料，黏土地最好施用腐熟度高的肥料。
⑵秸秆肥中有机质十分丰富，氮、磷、钾养分较为均衡，还含有各种微量元素，是各种作物、各种土壤都适宜的常用肥料，具有提高产品品质、增加产量的显著效果。
一般是补充钙磷等，但是不建议焚烧秸秆做肥料，因为焚烧中高温会破坏很多物质的结构，不利于秸秆充分发挥施肥的作用，污染空气不说，还有大量的浪费。建议你把秸秆发酵做生物有机肥。给你简单的说一下制作方法吧。
1） 发酵原料：如谷糠、杂草、人、畜、禽粪便、作物秸秆（切碎）、茎叶、锯末木屑、食用菌基质残渣和饼粕等。
2） 工具：搅拌机；塑料容器或水泥池（或者土坑垫塑料薄膜）；塑料薄膜；粉碎机（普通农用型）；铁锹。
3） 发酵菌：农盛乐种植菌液
4） 配比：谷糠、杂草、人、畜、禽粪便、作物秸秆（切碎）、茎叶、锯末木屑、食用菌基质残渣和饼粕等。准备200公斤材料和农盛乐种植菌液1公斤
5） 操作规程：
① 将发酵原料按配比准备400公斤，此为发酵原料待用；
② 将1公斤农盛乐种植菌液倒入50公斤水中稀释搅拌均匀，稀释用水最好为井水或河水，若为自来水请放置24小时后再用；能够适当的溶解一些红糖在里面效果更佳。
③ 如有搅拌机：可以先将发酵原料混合2分钟后，再倒入发酵剂稀释液搅拌6分钟；没有搅拌机：用铁锹搅拌按由少到多的原则，即先将菌液稀释液倒入少量发酵原料中搅拌均匀，直到没有团块，然后再将搅拌好的少量发酵原料倒入剩余发酵原料中搅拌均匀，直到没有团块；（注意：视发酵原料干湿程度增减稀释用水水量，稀释的菌液用水应是发酵原料的40%左右，拌成以手握成团，指缝见水但不滴水珠，松手即散为好。注意：水多了易酸，少了发酵不透。如发酵原料较湿，应减少稀释的用水量。）
④ 将混合后的发酵原料放入塑料容器或水泥池（或者土坑垫塑料薄膜）中，最后装满压实，排去空气后用塑料薄膜密封，一定要完全密闭，适宜温度为25-35℃，发酵5-10天（一般夏4天，春秋7天，冬10天），注意温度和时间的掌握，直到没有臭味含有酒味即为发酵成功。
以上的制作方法摘自《农盛乐技术手册》
豫公