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如何用ncbi查找比对基因序列

发布时间:2024-01-03   来源:ssss   标签:序列 基因 信息 编号 你的 点击:7
内容提要:GI编号是NCBI网站的所有序列相关数据库的流水编号,其最有用的特征就是唯一性对于每一条递交给NCBI的序列,都会付给一个编号,而且这个编号对应的序列不可更改这个编号对应这个唯一的一条序列,类似与我们用的身份证号因此,利用GI在NCBI中查

如何用ncbi查找比对基因序列,第1张

GI编号是NCBI网站的所有序列相关数据库的流水编号,其最有用的特征就是唯一性对于每一条递交给NCBI的序列,都会付给一个编号,而

且这个编号对应的序列不可更改这个编号对应这个唯一的一条序列,类似与我们用的身份证号因此,利用GI在NCBI中查询时,你只要把数据库(蛋白质/

核苷酸)选对,只要输入这个号码就可以把相应的序列调出来

值得一提的是登录号(Accession Number)每一个递交的序列,除了获得一个GI号,还会被赋予一个登录号递交序列的作者利用登录号对序列进行修改和完善每一次修改的序列会获得一个新的GI号,登录号不变,但会追加一个流水的版本号

因此,GI号和带版本号的登录号都唯一定位到唯一条序列

如果您已经成功登录了NCBI页面,并且得到了一个登录号,那么您的登录过程就已经成功了。

但是,如果您在NCBI页面上搜索不到您登录的基因,可能会有以下几种原因导致:

1 搜索关键词或参数不正确:请确保您使用的搜索关键词和参数是正确的,并且与您登录的基因信息一致。

2 基因信息不在NCBI数据库中:NCBI可能还没有您想查找的基因信息。您可以尝试在其他数据库中查找,或者联系相关的基因组学研究人员咨询。

3 网络连接问题:可能是由于网络连接不稳定或中断导致搜索不到基因信息。请确保您的网络连接正常,并尝试刷新页面或重新登录。

如果您仍然无法在NCBI页面上找到您登录的基因,建议您联系NCBI的技术支持团队,寻求帮助。

打开Pubmed后,在最顶上的下拉框中选中nucleotide, 然后输入基因的名称,这样查出来的一般是mRNA序列如果在下拉框中选Gene,则查出来的一般是该基因的其他信息。注意,结果一般会有好多,选中你要的种属。

你好!登录PUBMED官网,然后点击genomeic这个选项,输入关键词进行查询就好。如果你的英语不够好,可以借助工具书或者有道词典来进行翻译。当然,你也可以直接询问你的师姐师兄或者导师。

1、首先输入基因的完整学名,找到与基因相关的cDNA序列在这一cRNA序列的解说信息里,就已经有各外显子的分节

2、将该cDNA输入Blast进行序列比对,就可以找到其每一个外显子所对应的染色体位置,这些信息就显示了所有的外显子处于外显子两端的序列就是内含子

3、如你需要完整的基因序列,需要在blast中选择others这个数据库,然后查找相关的Bac质粒中含有你完整基因的文件,在其中找到你所需的信息

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